如意寶樹觀音學院使用的觀音儀軌，由第五世尊者達賴喇嘛編著。觀音事業法門的全集，收錄第四世班禪大師班禪洛桑曲傑所著的觀音餗供，帕繃卡仁波切依照班禪大師儀軌整理的百餘食子修法，火供儀軌為第十三世尊者的上師之一，比丘耶喜嘉措，依照宗大師的火供註解法本編纂。觀音自入灌頂儀軌，以及觀音自入灌頂前行的寶瓶加持，亦是由帕繃卡仁波切，依照宗大師的自入灌頂總論，三主要道以及第五世尊者的法本整理匯集而得。
灌頂，是獲得修持本尊的權利。藉由閉關，我們累積與本尊親近的過程。若欲所求遂願，速速成辦，當本尊儀軌的觀修專注自生的信心與把握越大，事業法的修持上才會強而具效。
觀音學院總共以五階段的課程，帶領學習者一步一步建立密法的藍圖，對於本尊禪修的關要，修法觀想重點。
一階：密續通識
無資格限制/兩堂課
- 解讀密法地圖：顯密特色，密續四部，事部法門
- 本尊儀軌的使用手冊：透過觀音儀軌進行實修的利益
二階：本尊儀軌講授
接受過觀音灌頂者才可參加/七堂課
- 事部瑜伽：觀音本尊儀軌，顯現與意義講解（三堂）
- 進入壇城：觀音木壇城導覽（三堂）
- 如何修持本尊儀軌，壇城，手印，鈴杵等（一堂）
三階：觀音禪修引導
接受過儀軌講授，完成初階觀音木壇城測驗者才可報名/兩堂課
- 儀軌進階講授，觀音木壇城進階引導 （五堂）
- 準備觀音本尊正式閉關，火供儀軌講授 （兩堂）
四階：觀音閉關實修
接受過觀音灌頂者可參加/三天
- 如意寶樹閉關中心觀音殿共修，每日四座
- 圓滿日火供
五階：觀音自入灌頂修持教授
觀音閉關圓滿者/兩堂課
- 自入灌頂儀軌講解
- 自入灌頂儀軌修持教授
一起來學習！「觀音學院」
教具，課本，與教室籌款中
觀音學院的[教具]木壇城雕刻製作，[課本]觀音總集法本翻譯，以及[教室]如意寶樹三樓規劃為實修事部本尊觀音法門，放置觀音木壇城的觀音殿。這些工程與籌備，都需要靠大家一起來實現。也會因為大家一起而充滿可能。
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